他们专为病毒做“亲子鉴定”，12小时精准查找感染源头和传播链

　　长沙晚报掌上长沙10月20日讯（全媒体记者 彭放 通讯员 王涵）自疫情发生以来，随着精准化防控的开展，“基因测序”一词常常被提及，除了核酸检测，大家也开始关注基因测序的结果。疫情源头在哪里？除了流行病学调查，还有没有更简便精准的方法来确定传播链条？这些问题都要借助基因测序的科技力量一一解开。今日，记者跟随长沙市疾控中心基因测序项目组，了解新冠病毒全基因组测序的方方面面。

　　长沙市疾控中心基因测序项目组骨干成员、微生物检验科技师黄政介绍，新冠病毒基因测序是对阳性病例鼻咽拭子标本中新冠病毒核苷酸序列的获取。这种基因测序技术是基于纳米孔的三代基因测序，从而能够在较短时间内获得新冠病毒的全基因组序列，结合流行病学资料，既可以判断新冠病毒疫情的感染来源，又可以对多个病例感染的病毒基因进行测序，判断是否为同一传播链，从而为疫情防控方案的制定提供重要依据。这项技术已经成为目前新冠病毒溯源分型的主要手段。

　　如果说核酸检测是为了发现病例，那么，基因测序是为了对发现的病例进一步进行流行病学分子溯源，协助现场流行病学调查查找感染源头和传播链条。譬如可以判断为外省或外地输入病例，甚至可以根据核苷酸突变的情况判断为本地病例的二代传播、三代传播。简单的说，病毒基因测序用于流行病学的分子溯源调查，相当于病毒的“亲子鉴定”。

　　“基因测序技术发展很快，从一代、二代，发展到目前的三代。长沙市疾控中心实验室使用的就是三代测序设备。”黄政介绍，和二代测序需要36～48小时相比，而三代测序的时间缩短到了12小时内。流调溯源时间缩短，为疫情防控措施的制定节约了宝贵的时间和资源，有利于更精准的防控，减轻对社会和经济的压力。

　　近一个月，团队共对35份样本开展了三代测序，结合流行病学调查，精准判断多起感染来源和传播链条。国庆期间，一名本地病例的感染源头一时难以确定。尽管经过流行病学调查，发现其与一名外省输入病例可能有时空交集，但流调队员反复查看现场监控视频，未发现两人共同暴露于同一个环境中。最终，通过三代基因测序，发现这两人的病毒基因序列高度同源，判断两人为同一传播链，为流行病学调查指明了方向。

　　长沙市疾控中心基因测序项目组是一个平均年龄不到30岁的年轻团队。他们在承担繁重的新冠核酸日常检测工作之余，一旦本市出现新冠病毒核酸检测阳性人员，项目组便马上对阳性样品启动基因测序。由于每天核酸检测大多晚上才出结果，基因测序工作往往在后半夜进行，项目组不分昼夜，分秒必争，绝大多数三代基因测序分析结果在凌晨3时以后发出。他们用“白加黑、连轴转”的辛勤付出，为长沙市疫情防控流调溯源提供数据支撑，发挥了实验室的“一锤定音”作用。